Komórki różnicują się, gdyż ujawniają się różne kombinacje genów obecnych w ich jądrach komórkowych. Mogłoby to się dokonać w dowolnym miejscu i czasie, ale komórka musi otrzymać określone sygnały, a sygnały takie mogą powstać jedynie w niektórych miejscach w rozwijającym się embrionie. Właśnie dzięki różnicowaniu komórki wątroby różnią się od komórek naskórka, a komórki naskórka są inne niż komórki nerwowe itd. Różnicowanie odbywa się dzięki specyficznym procesom produkcji białek – geny determinujące produkcję jednych białek są aktywne, a geny zawiadujące produkcją innych białek – nieaktywne. Każda komórka składa się z wielu białek, z których tylko niektóre są wspólne różnym typom komórek.Możemy teraz kontynuować opis rozwoju embrionalnego. Przyjrzyjmy się embrionowi kurczaka . Postępujący podział komórkowy w końcu doprowadza do powstania płaskiej tarczki komórek zwanej blastodermą, która zawiera ponad 100000 komórek. W tym momencie komórki po obu stronach linii środkowej w tylnej części blastodermy odrywają się i migrują poprzez część środkową, zwaną smugą pierwotną.